В Московском университете открыт факультет фундаментальной медицины. Тем самым в стенах МГУ восстанавливалась система медицинского образования, прерванная в 1930 г.
С 1992 года в МГУ были также созданы факультеты: государственного управления (1993), Высшая школа бизнеса (1994), педагогического образования (1997), дополнительного образования (1999), искусств (2001), биоинженерии и биоинформатики (2002), мировой политики (2003), Московская школа экономики (2004), Высшая школа государственного администрирования (2005), Высшая школа перевода (2005), физико-химический/фундаментальной физико-химической инженерии (2006), Высшая школа государственного аудита (2006), Высшая школа инновационного бизнеса (2006), Высшая школа управления и инноваций (2006), Высшая школа современных социальных наук (2007), Высшая школа телевидения (2007), глобальных процессов (2007), политологии (2008), Высшая школа культурной политики и управления в гуманитарной сфере (2011), биотехнологический (2013), космических исследований (2017).